１、本署目前管轄區域包括高雄市、屏東縣及澎湖縣等縣市，面積共有5848.7268平方公里，轄區內共有77個鄉鎮市，人口約375萬8仟餘人。

２、訴訟管轄之地方法院檢察署包括臺灣高雄地方檢察署、臺灣橋頭地方檢察署、臺灣屏東地方檢察署、臺灣澎湖地方檢察署。

 （一）在本署轄區內，業務歸本署督導之機關：

１、檢察機關：高雄、橋頭、屏東、澎湖等四地檢署。

２、看守所：高雄、屏東、澎湖等三看守所。

３、少年觀護所：高雄、屏東、澎湖少年觀護所。

（二）業務督導如下：

１、依「臺灣高等檢察署加強二審檢察功能實施要點」之規定，分別指派檢察官協助監督所屬各地檢署之業務，就其案件進行有無遲延、處理有無不當、有無其他疏失等項經常予以輔導考核外，必要時並調卷核閱，並於每年定期實施業務檢查。

２、督導及協調支援轄區各地檢署辦理重大刑事案件，以提昇其績效。

３、對查察賄選、肅貪及緝毒、破壞國土、擄鴿勒贖、職棒簽賭、霸屋及搬家勒索、智慧財產權、保護婦幼等重點工作，亦均指派檢察官分別督導及列席轄區各地檢署之執行小組會議。

４、督導所屬各地檢署加強推行並輔導鄉鎮市區調解業務，俾能有助疏解訟源，促進社會和諧。　

５、輪派檢察官視察轄區內看守所、少年觀護所業務。